如何对基因杂交进行卡方拟合优度检验?

卡方拟合优度检验通常用于遗传学。一个常见的应用是检查两个基因是否相连(即，如果分类是独立的)。当基因相连时，一个基因的遗传等位基因会影响另一个基因的遗传等位基因。

假设你想知道豌豆质地(R =圆形，R =褶皱)和颜色(Y =黄色，Y =绿色)的基因是否相关。在两个杂合子(RY / RY)豌豆植物。你在实验中测试的假设是:

• 零假设（H₀):后代种群遗传所有可能的基因型组合的概率相等。
  • 这表明这些基因是不相关的。
• 备择假设（H_一个:后代的数量不遗传所有可能的基因型组合的概率相等。
  • 这表明这些基因是相互关联的。

你观察100颗豌豆:

• 78颗圆形和黄色的豌豆
• 6颗圆形的绿色豌豆
• 4颗皱巴巴的黄豌豆
• 12颗皱巴巴的青豆

第一步:计算预期频率

为了计算期望值，你可以做一个庞尼特方格。如果这两个基因没有连锁，那么每个基因型组合的概率是相等的。

因此，预期的表型比例为9个圆形和黄色:3个圆形和绿色:3个皱褶和黄色:1个皱褶和绿色。

由此，你可以计算出100个豌豆的预期表型频率:

第二步:计算卡方

Χ²= 8.41 + 8.67 + 11.6 + 5.4 = 34.08

步骤3:找到临界卡方值

因为有四组(圆形和黄色，圆形和绿色，褶皱和黄色，褶皱和绿色)，所以有三组自由度．

对于α = .05和的显著性检验df= 3，则Χ²临界值为7.82。

步骤4:将卡方值与临界值进行比较

Χ²= 34.08

临界值= 7.82

的Χ²值大于临界值．

第五步:决定是否拒绝原假设

的Χ²值大于临界值，所以我们拒绝零假设，即后代群体遗传所有可能的基因型组合的概率相等。观察到的基因型频率与预期的基因型频率之间存在显著差异(p< . 05)。

这些数据支持了另一种假设，即后代遗传所有可能的基因型组合的概率并不相等，这表明这些基因是相连的